Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms