Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A2Q13296 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SCGB2A2Q13296 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
SCGB2A2Q13296 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SCGB2A2Q13296 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SCGB2A2Q13296 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SCGB2A2Q13296 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SCGB2A2Q13296 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SCGB2A2Q13296 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SCGB2A2Q13296 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SCGB2A2Q13296 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SCGB2A2Q13296 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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SCGB2A2Q13296 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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SCGB2A2Q13296 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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SCGB2A2Q13296 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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SCGB2A2Q13296 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
SCGB2A2Q13296 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SCGB2A2Q13296 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SCGB2A2Q13296 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SCGB2A2Q13296 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SCGB2A2Q13296 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
SCGB2A2Q13296 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SCGB2A2Q13296 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SCGB2A2Q13296 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SCGB2A2Q13296 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SCGB2A2Q13296 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
SCGB2A2Q13296 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SCGB2A2Q13296 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SCGB2A2Q13296 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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