Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
NME3Q13232 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NME3Q13232 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NME3Q13232 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NME3Q13232 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NME3Q13232 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NME3Q13232 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NME3Q13232 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NME3Q13232 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NME3Q13232 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NME3Q13232 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NME3Q13232 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NME3Q13232 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NME3Q13232 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NME3Q13232 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
NME3Q13232 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
NME3Q13232 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NME3Q13232 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NME3Q13232 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NME3Q13232 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NME3Q13232 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NME3Q13232 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NME3Q13232 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NME3Q13232 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NME3Q13232 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NME3Q13232 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NME3Q13232 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NME3Q13232 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
NME3Q13232 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NME3Q13232 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NME3Q13232 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NME3Q13232 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
NME3Q13232 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NME3Q13232 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NME3Q13232 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NME3Q13232 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NME3Q13232 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NME3Q13232 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
NME3Q13232 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NME3Q13232 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NME3Q13232 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
NME3Q13232 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NME3Q13232 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NME3Q13232 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NME3Q13232 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NME3Q13232 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NME3Q13232 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NME3Q13232 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NME3Q13232 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NME3Q13232 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NME3Q13232 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NME3Q13232 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NME3Q13232 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NME3Q13232 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NME3Q13232 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NME3Q13232 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NME3Q13232 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NME3Q13232 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NME3Q13232 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NME3Q13232 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NME3Q13232 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NME3Q13232 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NME3Q13232 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NME3Q13232 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NME3Q13232 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NME3Q13232 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NME3Q13232 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NME3Q13232 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NME3Q13232 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NME3Q13232 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NME3Q13232 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NME3Q13232 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NME3Q13232 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NME3Q13232 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NME3Q13232 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NME3Q13232 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NME3Q13232 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NME3Q13232 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NME3Q13232 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NME3Q13232 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NME3Q13232 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NME3Q13232 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NME3Q13232 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NME3Q13232 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NME3Q13232 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NME3Q13232 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NME3Q13232 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NME3Q13232 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NME3Q13232 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NME3Q13232 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NME3Q13232 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NME3Q13232 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NME3Q13232 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NME3Q13232 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NME3Q13232 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NME3Q13232 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NME3Q13232 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NME3Q13232 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NME3Q13232 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NME3Q13232 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
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