Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
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