Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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GPS1Q13098 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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GPS1Q13098 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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GPS1Q13098 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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GPS1Q13098 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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GPS1Q13098 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
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GPS1Q13098 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
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GPS1Q13098 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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GPS1Q13098 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
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