Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
MRPL28Q13084 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
MRPL28Q13084 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
MRPL28Q13084 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
MRPL28Q13084 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
MRPL28Q13084 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
MRPL28Q13084 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
MRPL28Q13084 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
MRPL28Q13084 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
MRPL28Q13084 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
MRPL28Q13084 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
MRPL28Q13084 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
MRPL28Q13084 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
MRPL28Q13084 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
MRPL28Q13084 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
MRPL28Q13084 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
MRPL28Q13084 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
MRPL28Q13084 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
MRPL28Q13084 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
MRPL28Q13084 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
MRPL28Q13084 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
MRPL28Q13084 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
MRPL28Q13084 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
MRPL28Q13084 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MRPL28Q13084 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MRPL28Q13084 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MRPL28Q13084 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MRPL28Q13084 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MRPL28Q13084 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MRPL28Q13084 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MRPL28Q13084 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MRPL28Q13084 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MRPL28Q13084 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MRPL28Q13084 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MRPL28Q13084 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
MRPL28Q13084 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MRPL28Q13084 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MRPL28Q13084 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MRPL28Q13084 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MRPL28Q13084 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MRPL28Q13084 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MRPL28Q13084 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MRPL28Q13084 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MRPL28Q13084 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MRPL28Q13084 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MRPL28Q13084 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MRPL28Q13084 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
MRPL28Q13084 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
MRPL28Q13084 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MRPL28Q13084 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MRPL28Q13084 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MRPL28Q13084 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
MRPL28Q13084 SAMD4A-202ENST00000392067 6833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MRPL28Q13084 HIPK3-202ENST00000379016 7345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MRPL28Q13084 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MRPL28Q13084 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MRPL28Q13084 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MRPL28Q13084 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MRPL28Q13084 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MRPL28Q13084 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MRPL28Q13084 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MRPL28Q13084 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MRPL28Q13084 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MRPL28Q13084 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
MRPL28Q13084 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MRPL28Q13084 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MRPL28Q13084 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MRPL28Q13084 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MRPL28Q13084 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MRPL28Q13084 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MRPL28Q13084 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MRPL28Q13084 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MRPL28Q13084 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MRPL28Q13084 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MRPL28Q13084 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MRPL28Q13084 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MRPL28Q13084 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MRPL28Q13084 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MRPL28Q13084 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MRPL28Q13084 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MRPL28Q13084 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MRPL28Q13084 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MRPL28Q13084 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MRPL28Q13084 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MRPL28Q13084 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
MRPL28Q13084 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MRPL28Q13084 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MRPL28Q13084 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MRPL28Q13084 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MRPL28Q13084 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MRPL28Q13084 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
MRPL28Q13084 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
MRPL28Q13084 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MRPL28Q13084 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MRPL28Q13084 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MRPL28Q13084 KIAA0513-202ENST00000538274 7381 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MRPL28Q13084 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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