Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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FOXF1Q12946 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
FOXF1Q12946 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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FOXF1Q12946 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FOXF1Q12946 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
FOXF1Q12946 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
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FOXF1Q12946 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FOXF1Q12946 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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FOXF1Q12946 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FOXF1Q12946 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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FOXF1Q12946 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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FOXF1Q12946 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
FOXF1Q12946 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
FOXF1Q12946 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
FOXF1Q12946 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
FOXF1Q12946 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
FOXF1Q12946 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
FOXF1Q12946 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
FOXF1Q12946 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
FOXF1Q12946 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.1
FOXF1Q12946 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
FOXF1Q12946 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
FOXF1Q12946 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
FOXF1Q12946 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
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