Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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SMARCB1Q12824 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
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SMARCB1Q12824 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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