Protein–RNA interactions for Protein: Q12792

TWF1, Twinfilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF1Q12792 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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TWF1Q12792 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
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TWF1Q12792 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
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TWF1Q12792 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
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TWF1Q12792 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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TWF1Q12792 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
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