Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
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