Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PDE4DQ08499 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms