Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms