Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP7AQ04656 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP7AQ04656 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP7AQ04656 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP7AQ04656 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP7AQ04656 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP7AQ04656 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP7AQ04656 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP7AQ04656 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP7AQ04656 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP7AQ04656 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP7AQ04656 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP7AQ04656 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP7AQ04656 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP7AQ04656 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP7AQ04656 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP7AQ04656 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP7AQ04656 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP7AQ04656 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP7AQ04656 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP7AQ04656 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP7AQ04656 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP7AQ04656 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP7AQ04656 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP7AQ04656 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP7AQ04656 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP7AQ04656 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP7AQ04656 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP7AQ04656 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP7AQ04656 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP7AQ04656 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP7AQ04656 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP7AQ04656 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP7AQ04656 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP7AQ04656 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP7AQ04656 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP7AQ04656 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP7AQ04656 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP7AQ04656 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP7AQ04656 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP7AQ04656 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP7AQ04656 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP7AQ04656 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP7AQ04656 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP7AQ04656 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP7AQ04656 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP7AQ04656 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP7AQ04656 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP7AQ04656 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP7AQ04656 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP7AQ04656 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP7AQ04656 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP7AQ04656 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP7AQ04656 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP7AQ04656 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP7AQ04656 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP7AQ04656 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP7AQ04656 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP7AQ04656 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP7AQ04656 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ATP7AQ04656 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ATP7AQ04656 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ATP7AQ04656 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ATP7AQ04656 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ATP7AQ04656 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ATP7AQ04656 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ATP7AQ04656 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ATP7AQ04656 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ATP7AQ04656 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ATP7AQ04656 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ATP7AQ04656 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ATP7AQ04656 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
ATP7AQ04656 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ATP7AQ04656 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ATP7AQ04656 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
ATP7AQ04656 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
ATP7AQ04656 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ATP7AQ04656 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ATP7AQ04656 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ATP7AQ04656 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ATP7AQ04656 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ATP7AQ04656 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ATP7AQ04656 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP7AQ04656 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP7AQ04656 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP7AQ04656 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP7AQ04656 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP7AQ04656 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP7AQ04656 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP7AQ04656 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP7AQ04656 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP7AQ04656 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP7AQ04656 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP7AQ04656 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP7AQ04656 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP7AQ04656 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP7AQ04656 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP7AQ04656 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP7AQ04656 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP7AQ04656 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms