Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms