Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms