Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms