Protein–RNA interactions for Protein: Q01518

CAP1, Adenylyl cyclase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAP1Q01518 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAP1Q01518 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAP1Q01518 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAP1Q01518 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAP1Q01518 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAP1Q01518 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAP1Q01518 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAP1Q01518 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAP1Q01518 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAP1Q01518 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAP1Q01518 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAP1Q01518 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAP1Q01518 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CAP1Q01518 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAP1Q01518 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAP1Q01518 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CAP1Q01518 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAP1Q01518 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CAP1Q01518 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAP1Q01518 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAP1Q01518 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CAP1Q01518 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAP1Q01518 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAP1Q01518 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAP1Q01518 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAP1Q01518 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAP1Q01518 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAP1Q01518 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CAP1Q01518 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CAP1Q01518 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAP1Q01518 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CAP1Q01518 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAP1Q01518 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAP1Q01518 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAP1Q01518 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAP1Q01518 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAP1Q01518 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAP1Q01518 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAP1Q01518 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAP1Q01518 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAP1Q01518 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAP1Q01518 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAP1Q01518 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAP1Q01518 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAP1Q01518 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAP1Q01518 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAP1Q01518 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAP1Q01518 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAP1Q01518 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAP1Q01518 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAP1Q01518 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAP1Q01518 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAP1Q01518 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAP1Q01518 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAP1Q01518 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAP1Q01518 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAP1Q01518 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAP1Q01518 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAP1Q01518 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAP1Q01518 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAP1Q01518 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAP1Q01518 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAP1Q01518 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAP1Q01518 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAP1Q01518 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAP1Q01518 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAP1Q01518 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAP1Q01518 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAP1Q01518 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAP1Q01518 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAP1Q01518 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAP1Q01518 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAP1Q01518 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAP1Q01518 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CAP1Q01518 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAP1Q01518 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAP1Q01518 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAP1Q01518 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAP1Q01518 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAP1Q01518 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAP1Q01518 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAP1Q01518 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CAP1Q01518 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAP1Q01518 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAP1Q01518 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAP1Q01518 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAP1Q01518 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CAP1Q01518 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CAP1Q01518 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CAP1Q01518 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CAP1Q01518 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CAP1Q01518 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CAP1Q01518 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CAP1Q01518 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CAP1Q01518 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CAP1Q01518 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CAP1Q01518 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CAP1Q01518 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CAP1Q01518 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CAP1Q01518 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms