Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLTCQ00610 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLTCQ00610 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLTCQ00610 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLTCQ00610 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLTCQ00610 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLTCQ00610 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLTCQ00610 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CLTCQ00610 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLTCQ00610 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLTCQ00610 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLTCQ00610 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLTCQ00610 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLTCQ00610 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLTCQ00610 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLTCQ00610 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLTCQ00610 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLTCQ00610 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLTCQ00610 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLTCQ00610 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLTCQ00610 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CLTCQ00610 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CLTCQ00610 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLTCQ00610 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLTCQ00610 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLTCQ00610 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLTCQ00610 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CLTCQ00610 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CLTCQ00610 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CLTCQ00610 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CLTCQ00610 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CLTCQ00610 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CLTCQ00610 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLTCQ00610 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLTCQ00610 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLTCQ00610 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLTCQ00610 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLTCQ00610 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLTCQ00610 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLTCQ00610 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLTCQ00610 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLTCQ00610 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLTCQ00610 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLTCQ00610 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CLTCQ00610 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLTCQ00610 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLTCQ00610 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLTCQ00610 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLTCQ00610 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLTCQ00610 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLTCQ00610 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLTCQ00610 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLTCQ00610 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLTCQ00610 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLTCQ00610 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLTCQ00610 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLTCQ00610 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLTCQ00610 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLTCQ00610 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLTCQ00610 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CLTCQ00610 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CLTCQ00610 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLTCQ00610 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLTCQ00610 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CLTCQ00610 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CLTCQ00610 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLTCQ00610 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLTCQ00610 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLTCQ00610 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLTCQ00610 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLTCQ00610 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLTCQ00610 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLTCQ00610 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLTCQ00610 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLTCQ00610 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLTCQ00610 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLTCQ00610 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CLTCQ00610 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLTCQ00610 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLTCQ00610 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CLTCQ00610 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLTCQ00610 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLTCQ00610 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLTCQ00610 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLTCQ00610 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLTCQ00610 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLTCQ00610 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CLTCQ00610 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLTCQ00610 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLTCQ00610 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLTCQ00610 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLTCQ00610 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLTCQ00610 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLTCQ00610 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLTCQ00610 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLTCQ00610 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLTCQ00610 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLTCQ00610 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLTCQ00610 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLTCQ00610 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms