Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms