Protein–RNA interactions for Protein: P61247

RPS3A, 40S ribosomal protein S3a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP61247 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RPS3AP61247 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RPS3AP61247 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
RPS3AP61247 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RPS3AP61247 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RPS3AP61247 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RPS3AP61247 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RPS3AP61247 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RPS3AP61247 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPS3AP61247 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPS3AP61247 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPS3AP61247 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPS3AP61247 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.08■□□□□ 0
RPS3AP61247 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPS3AP61247 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
RPS3AP61247 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPS3AP61247 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPS3AP61247 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RPS3AP61247 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPS3AP61247 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPS3AP61247 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RPS3AP61247 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RPS3AP61247 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPS3AP61247 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RPS3AP61247 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RPS3AP61247 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPS3AP61247 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RPS3AP61247 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RPS3AP61247 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPS3AP61247 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPS3AP61247 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RPS3AP61247 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RPS3AP61247 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPS3AP61247 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPS3AP61247 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RPS3AP61247 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPS3AP61247 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RPS3AP61247 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPS3AP61247 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RPS3AP61247 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPS3AP61247 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RPS3AP61247 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPS3AP61247 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RPS3AP61247 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPS3AP61247 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPS3AP61247 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPS3AP61247 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPS3AP61247 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RPS3AP61247 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RPS3AP61247 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RPS3AP61247 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
RPS3AP61247 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RPS3AP61247 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RPS3AP61247 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPS3AP61247 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RPS3AP61247 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RPS3AP61247 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPS3AP61247 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPS3AP61247 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RPS3AP61247 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RPS3AP61247 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPS3AP61247 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPS3AP61247 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RPS3AP61247 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPS3AP61247 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RPS3AP61247 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPS3AP61247 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPS3AP61247 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RPS3AP61247 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RPS3AP61247 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RPS3AP61247 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RPS3AP61247 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RPS3AP61247 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPS3AP61247 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPS3AP61247 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPS3AP61247 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPS3AP61247 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RPS3AP61247 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPS3AP61247 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPS3AP61247 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPS3AP61247 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPS3AP61247 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RPS3AP61247 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RPS3AP61247 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPS3AP61247 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPS3AP61247 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPS3AP61247 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPS3AP61247 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RPS3AP61247 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPS3AP61247 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RPS3AP61247 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RPS3AP61247 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RPS3AP61247 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPS3AP61247 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RPS3AP61247 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPS3AP61247 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPS3AP61247 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RPS3AP61247 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RPS3AP61247 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPS3AP61247 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms