Protein–RNA interactions for Protein: P56817

BACE1, Beta-secretase 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BACE1P56817 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BACE1P56817 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BACE1P56817 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BACE1P56817 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BACE1P56817 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BACE1P56817 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BACE1P56817 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BACE1P56817 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BACE1P56817 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BACE1P56817 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BACE1P56817 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BACE1P56817 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BACE1P56817 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
BACE1P56817 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
BACE1P56817 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BACE1P56817 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BACE1P56817 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BACE1P56817 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BACE1P56817 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
BACE1P56817 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BACE1P56817 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
BACE1P56817 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BACE1P56817 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BACE1P56817 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BACE1P56817 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BACE1P56817 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BACE1P56817 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BACE1P56817 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BACE1P56817 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BACE1P56817 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BACE1P56817 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
BACE1P56817 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BACE1P56817 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BACE1P56817 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BACE1P56817 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BACE1P56817 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BACE1P56817 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BACE1P56817 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BACE1P56817 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BACE1P56817 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BACE1P56817 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BACE1P56817 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BACE1P56817 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BACE1P56817 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BACE1P56817 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BACE1P56817 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BACE1P56817 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BACE1P56817 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BACE1P56817 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BACE1P56817 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BACE1P56817 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BACE1P56817 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BACE1P56817 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BACE1P56817 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BACE1P56817 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
BACE1P56817 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BACE1P56817 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
BACE1P56817 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BACE1P56817 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
BACE1P56817 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
BACE1P56817 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
BACE1P56817 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BACE1P56817 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BACE1P56817 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BACE1P56817 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BACE1P56817 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BACE1P56817 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BACE1P56817 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BACE1P56817 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BACE1P56817 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BACE1P56817 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BACE1P56817 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BACE1P56817 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BACE1P56817 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BACE1P56817 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
BACE1P56817 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BACE1P56817 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BACE1P56817 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BACE1P56817 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BACE1P56817 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BACE1P56817 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BACE1P56817 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BACE1P56817 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BACE1P56817 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BACE1P56817 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BACE1P56817 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BACE1P56817 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BACE1P56817 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BACE1P56817 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BACE1P56817 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BACE1P56817 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
BACE1P56817 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BACE1P56817 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BACE1P56817 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BACE1P56817 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BACE1P56817 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BACE1P56817 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BACE1P56817 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BACE1P56817 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BACE1P56817 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms