Protein–RNA interactions for Protein: P53803

POLR2K, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2KP53803 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
POLR2KP53803 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
POLR2KP53803 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
POLR2KP53803 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
POLR2KP53803 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
POLR2KP53803 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
POLR2KP53803 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
POLR2KP53803 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
POLR2KP53803 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
POLR2KP53803 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
POLR2KP53803 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
POLR2KP53803 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
POLR2KP53803 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
POLR2KP53803 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
POLR2KP53803 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
POLR2KP53803 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
POLR2KP53803 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
POLR2KP53803 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
POLR2KP53803 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
POLR2KP53803 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
POLR2KP53803 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
POLR2KP53803 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
POLR2KP53803 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
POLR2KP53803 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
POLR2KP53803 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
POLR2KP53803 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
POLR2KP53803 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
POLR2KP53803 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
POLR2KP53803 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
POLR2KP53803 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
POLR2KP53803 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
POLR2KP53803 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
POLR2KP53803 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
POLR2KP53803 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
POLR2KP53803 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
POLR2KP53803 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
POLR2KP53803 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
POLR2KP53803 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
POLR2KP53803 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
POLR2KP53803 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
POLR2KP53803 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
POLR2KP53803 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
POLR2KP53803 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
POLR2KP53803 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
POLR2KP53803 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
POLR2KP53803 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
POLR2KP53803 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
POLR2KP53803 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
POLR2KP53803 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
POLR2KP53803 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
POLR2KP53803 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
POLR2KP53803 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
POLR2KP53803 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
POLR2KP53803 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
POLR2KP53803 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
POLR2KP53803 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
POLR2KP53803 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
POLR2KP53803 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
POLR2KP53803 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
POLR2KP53803 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
POLR2KP53803 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
POLR2KP53803 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
POLR2KP53803 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
POLR2KP53803 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
POLR2KP53803 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
POLR2KP53803 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
POLR2KP53803 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
POLR2KP53803 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
POLR2KP53803 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
POLR2KP53803 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
POLR2KP53803 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
POLR2KP53803 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
POLR2KP53803 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
POLR2KP53803 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
POLR2KP53803 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
POLR2KP53803 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
POLR2KP53803 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
POLR2KP53803 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC11.34□□□□□ -0.59
POLR2KP53803 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
POLR2KP53803 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
POLR2KP53803 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
POLR2KP53803 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
POLR2KP53803 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
POLR2KP53803 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC11.34□□□□□ -0.59
POLR2KP53803 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
POLR2KP53803 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
POLR2KP53803 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
POLR2KP53803 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
POLR2KP53803 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
POLR2KP53803 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
POLR2KP53803 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
POLR2KP53803 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
POLR2KP53803 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
POLR2KP53803 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
POLR2KP53803 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
POLR2KP53803 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
POLR2KP53803 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
POLR2KP53803 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
POLR2KP53803 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
POLR2KP53803 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms