Protein–RNA interactions for Protein: P49759

CLK1, Dual specificity protein kinase CLK1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK1P49759 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLK1P49759 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLK1P49759 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLK1P49759 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLK1P49759 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLK1P49759 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLK1P49759 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CLK1P49759 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLK1P49759 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLK1P49759 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLK1P49759 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CLK1P49759 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLK1P49759 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLK1P49759 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLK1P49759 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLK1P49759 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CLK1P49759 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CLK1P49759 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLK1P49759 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLK1P49759 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLK1P49759 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLK1P49759 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLK1P49759 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLK1P49759 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLK1P49759 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLK1P49759 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLK1P49759 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLK1P49759 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLK1P49759 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLK1P49759 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLK1P49759 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLK1P49759 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLK1P49759 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLK1P49759 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLK1P49759 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLK1P49759 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLK1P49759 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLK1P49759 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLK1P49759 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLK1P49759 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLK1P49759 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLK1P49759 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLK1P49759 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLK1P49759 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLK1P49759 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLK1P49759 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLK1P49759 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CLK1P49759 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLK1P49759 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLK1P49759 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLK1P49759 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLK1P49759 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLK1P49759 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLK1P49759 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CLK1P49759 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLK1P49759 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLK1P49759 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLK1P49759 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CLK1P49759 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CLK1P49759 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLK1P49759 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLK1P49759 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLK1P49759 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLK1P49759 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLK1P49759 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLK1P49759 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLK1P49759 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLK1P49759 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLK1P49759 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLK1P49759 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLK1P49759 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLK1P49759 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLK1P49759 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLK1P49759 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLK1P49759 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLK1P49759 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLK1P49759 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLK1P49759 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLK1P49759 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLK1P49759 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLK1P49759 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CLK1P49759 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLK1P49759 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLK1P49759 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLK1P49759 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLK1P49759 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLK1P49759 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLK1P49759 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLK1P49759 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLK1P49759 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLK1P49759 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLK1P49759 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLK1P49759 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLK1P49759 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLK1P49759 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLK1P49759 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CLK1P49759 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLK1P49759 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CLK1P49759 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CLK1P49759 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms