Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 AC009119.2-201ENST00000561562 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NESP48681 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NESP48681 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NESP48681 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NESP48681 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NESP48681 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NESP48681 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NESP48681 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NESP48681 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NESP48681 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NESP48681 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NESP48681 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NESP48681 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NESP48681 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NESP48681 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NESP48681 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NESP48681 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NESP48681 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NESP48681 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NESP48681 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NESP48681 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NESP48681 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NESP48681 AL022344.2-201ENST00000568976 968 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
NESP48681 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NESP48681 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NESP48681 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NESP48681 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NESP48681 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NESP48681 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NESP48681 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NESP48681 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NESP48681 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NESP48681 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NESP48681 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NESP48681 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NESP48681 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NESP48681 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NESP48681 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NESP48681 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
NESP48681 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NESP48681 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NESP48681 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NESP48681 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NESP48681 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NESP48681 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NESP48681 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NESP48681 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NESP48681 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NESP48681 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NESP48681 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NESP48681 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NESP48681 HBB-201ENST00000335295 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NESP48681 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
NESP48681 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NESP48681 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NESP48681 FAU-202ENST00000434372 533 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NESP48681 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NESP48681 AC026410.1-201ENST00000507366 1101 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
NESP48681 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NESP48681 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NESP48681 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NESP48681 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NESP48681 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NESP48681 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NESP48681 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NESP48681 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NESP48681 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
NESP48681 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NESP48681 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NESP48681 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NESP48681 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NESP48681 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NESP48681 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
NESP48681 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NESP48681 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NESP48681 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NESP48681 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NESP48681 Z97652.1-201ENST00000415176 329 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NESP48681 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NESP48681 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NESP48681 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NESP48681 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NESP48681 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NESP48681 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NESP48681 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NESP48681 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NESP48681 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NESP48681 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NESP48681 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NESP48681 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NESP48681 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NESP48681 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NESP48681 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NESP48681 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NESP48681 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NESP48681 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NESP48681 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NESP48681 CTNNBIP1-201ENST00000377256 451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NESP48681 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NESP48681 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms