Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGAEP38570 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGAEP38570 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGAEP38570 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGAEP38570 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGAEP38570 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGAEP38570 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGAEP38570 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGAEP38570 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGAEP38570 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGAEP38570 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGAEP38570 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGAEP38570 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGAEP38570 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGAEP38570 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGAEP38570 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGAEP38570 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGAEP38570 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGAEP38570 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGAEP38570 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGAEP38570 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGAEP38570 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITGAEP38570 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITGAEP38570 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITGAEP38570 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITGAEP38570 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITGAEP38570 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITGAEP38570 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITGAEP38570 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITGAEP38570 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITGAEP38570 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITGAEP38570 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITGAEP38570 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITGAEP38570 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ITGAEP38570 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITGAEP38570 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITGAEP38570 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITGAEP38570 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITGAEP38570 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITGAEP38570 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITGAEP38570 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITGAEP38570 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITGAEP38570 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITGAEP38570 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ITGAEP38570 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ITGAEP38570 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITGAEP38570 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITGAEP38570 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITGAEP38570 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITGAEP38570 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITGAEP38570 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITGAEP38570 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGAEP38570 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGAEP38570 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGAEP38570 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGAEP38570 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGAEP38570 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGAEP38570 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGAEP38570 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGAEP38570 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGAEP38570 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGAEP38570 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGAEP38570 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGAEP38570 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGAEP38570 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGAEP38570 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGAEP38570 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGAEP38570 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGAEP38570 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGAEP38570 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGAEP38570 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGAEP38570 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGAEP38570 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGAEP38570 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGAEP38570 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGAEP38570 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGAEP38570 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGAEP38570 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGAEP38570 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGAEP38570 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGAEP38570 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGAEP38570 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGAEP38570 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ITGAEP38570 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ITGAEP38570 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ITGAEP38570 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ITGAEP38570 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ITGAEP38570 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ITGAEP38570 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ITGAEP38570 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ITGAEP38570 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ITGAEP38570 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ITGAEP38570 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ITGAEP38570 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ITGAEP38570 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ITGAEP38570 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ITGAEP38570 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ITGAEP38570 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ITGAEP38570 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ITGAEP38570 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms