Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms