Protein–RNA interactions for Protein: P32239

CCKBR, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKBRP32239 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms