Protein–RNA interactions for Protein: P31327

CPS1, Carbamoyl-phosphate synthase [ammonia], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1P31327 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CPS1P31327 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CPS1P31327 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CPS1P31327 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CPS1P31327 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CPS1P31327 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CPS1P31327 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CPS1P31327 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CPS1P31327 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CPS1P31327 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CPS1P31327 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CPS1P31327 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CPS1P31327 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CPS1P31327 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CPS1P31327 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CPS1P31327 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CPS1P31327 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CPS1P31327 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CPS1P31327 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CPS1P31327 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CPS1P31327 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CPS1P31327 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CPS1P31327 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CPS1P31327 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CPS1P31327 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CPS1P31327 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CPS1P31327 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CPS1P31327 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CPS1P31327 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CPS1P31327 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CPS1P31327 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CPS1P31327 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CPS1P31327 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CPS1P31327 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CPS1P31327 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CPS1P31327 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CPS1P31327 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CPS1P31327 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CPS1P31327 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CPS1P31327 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CPS1P31327 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CPS1P31327 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CPS1P31327 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CPS1P31327 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CPS1P31327 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CPS1P31327 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CPS1P31327 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CPS1P31327 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CPS1P31327 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CPS1P31327 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CPS1P31327 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CPS1P31327 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CPS1P31327 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CPS1P31327 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CPS1P31327 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CPS1P31327 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CPS1P31327 PPOX-204ENST00000462866 473 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CPS1P31327 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CPS1P31327 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CPS1P31327 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CPS1P31327 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CPS1P31327 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CPS1P31327 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CPS1P31327 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CPS1P31327 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CPS1P31327 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CPS1P31327 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CPS1P31327 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CPS1P31327 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CPS1P31327 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CPS1P31327 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CPS1P31327 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CPS1P31327 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CPS1P31327 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CPS1P31327 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CPS1P31327 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPS1P31327 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPS1P31327 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPS1P31327 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPS1P31327 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPS1P31327 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPS1P31327 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPS1P31327 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPS1P31327 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPS1P31327 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPS1P31327 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CPS1P31327 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CPS1P31327 MEF2C-AS2-201ENST00000510274 463 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPS1P31327 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPS1P31327 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPS1P31327 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPS1P31327 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPS1P31327 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPS1P31327 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPS1P31327 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPS1P31327 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPS1P31327 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPS1P31327 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPS1P31327 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPS1P31327 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.1 ms