Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GTF2E1P29083 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GTF2E1P29083 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GTF2E1P29083 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GTF2E1P29083 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GTF2E1P29083 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GTF2E1P29083 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GTF2E1P29083 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GTF2E1P29083 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GTF2E1P29083 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
GTF2E1P29083 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GTF2E1P29083 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
GTF2E1P29083 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GTF2E1P29083 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
GTF2E1P29083 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GTF2E1P29083 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GTF2E1P29083 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GTF2E1P29083 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GTF2E1P29083 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GTF2E1P29083 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GTF2E1P29083 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GTF2E1P29083 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
GTF2E1P29083 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GTF2E1P29083 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GTF2E1P29083 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GTF2E1P29083 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC20■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC20■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC20■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC20■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC20■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC20■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms