Protein–RNA interactions for Protein: P28566

HTR1E, 5-hydroxytryptamine receptor 1E, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR1EP28566 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTR1EP28566 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTR1EP28566 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HTR1EP28566 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTR1EP28566 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTR1EP28566 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTR1EP28566 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTR1EP28566 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTR1EP28566 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTR1EP28566 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTR1EP28566 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTR1EP28566 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTR1EP28566 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTR1EP28566 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTR1EP28566 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTR1EP28566 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTR1EP28566 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTR1EP28566 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTR1EP28566 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTR1EP28566 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTR1EP28566 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTR1EP28566 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTR1EP28566 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HTR1EP28566 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTR1EP28566 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTR1EP28566 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTR1EP28566 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTR1EP28566 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTR1EP28566 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTR1EP28566 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTR1EP28566 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTR1EP28566 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTR1EP28566 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTR1EP28566 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTR1EP28566 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTR1EP28566 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HTR1EP28566 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTR1EP28566 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTR1EP28566 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HTR1EP28566 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HTR1EP28566 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTR1EP28566 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTR1EP28566 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTR1EP28566 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTR1EP28566 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTR1EP28566 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTR1EP28566 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HTR1EP28566 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTR1EP28566 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTR1EP28566 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTR1EP28566 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTR1EP28566 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTR1EP28566 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTR1EP28566 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTR1EP28566 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTR1EP28566 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTR1EP28566 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTR1EP28566 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTR1EP28566 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTR1EP28566 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR1EP28566 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR1EP28566 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR1EP28566 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR1EP28566 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR1EP28566 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR1EP28566 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR1EP28566 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR1EP28566 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR1EP28566 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR1EP28566 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR1EP28566 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR1EP28566 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR1EP28566 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR1EP28566 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR1EP28566 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR1EP28566 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR1EP28566 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR1EP28566 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR1EP28566 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR1EP28566 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR1EP28566 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR1EP28566 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR1EP28566 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR1EP28566 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR1EP28566 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR1EP28566 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR1EP28566 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR1EP28566 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR1EP28566 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR1EP28566 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR1EP28566 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR1EP28566 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR1EP28566 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR1EP28566 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR1EP28566 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR1EP28566 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR1EP28566 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR1EP28566 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR1EP28566 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR1EP28566 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms