Protein–RNA interactions for Protein: P28360

MSX1, Homeobox protein MSX-1, humanhuman

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Length 303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSX1P28360 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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MSX1P28360 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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MSX1P28360 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MSX1P28360 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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MSX1P28360 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MSX1P28360 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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MSX1P28360 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MSX1P28360 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MSX1P28360 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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MSX1P28360 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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MSX1P28360 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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MSX1P28360 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MSX1P28360 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MSX1P28360 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MSX1P28360 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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MSX1P28360 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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MSX1P28360 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MSX1P28360 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MSX1P28360 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MSX1P28360 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MSX1P28360 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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MSX1P28360 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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MSX1P28360 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MSX1P28360 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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MSX1P28360 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MSX1P28360 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MSX1P28360 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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MSX1P28360 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MSX1P28360 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MSX1P28360 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MSX1P28360 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MSX1P28360 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MSX1P28360 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MSX1P28360 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MSX1P28360 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
MSX1P28360 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MSX1P28360 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MSX1P28360 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MSX1P28360 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MSX1P28360 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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