Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
POLD1P28340 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
POLD1P28340 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
POLD1P28340 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
POLD1P28340 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
POLD1P28340 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
POLD1P28340 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
POLD1P28340 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC19.7■□□□□ 0.74
POLD1P28340 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
POLD1P28340 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
POLD1P28340 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
POLD1P28340 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
POLD1P28340 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
POLD1P28340 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
POLD1P28340 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
POLD1P28340 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
POLD1P28340 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
POLD1P28340 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
POLD1P28340 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
POLD1P28340 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
POLD1P28340 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
POLD1P28340 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
POLD1P28340 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
POLD1P28340 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
POLD1P28340 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
POLD1P28340 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
POLD1P28340 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
POLD1P28340 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
POLD1P28340 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
POLD1P28340 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
POLD1P28340 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
POLD1P28340 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC19.7■□□□□ 0.74
POLD1P28340 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
POLD1P28340 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
POLD1P28340 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
POLD1P28340 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
POLD1P28340 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
POLD1P28340 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
POLD1P28340 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
POLD1P28340 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
POLD1P28340 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
POLD1P28340 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
POLD1P28340 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
POLD1P28340 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
POLD1P28340 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
POLD1P28340 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
POLD1P28340 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
POLD1P28340 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
POLD1P28340 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
POLD1P28340 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
POLD1P28340 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
POLD1P28340 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
POLD1P28340 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
POLD1P28340 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
POLD1P28340 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
POLD1P28340 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
POLD1P28340 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
POLD1P28340 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
POLD1P28340 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
POLD1P28340 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
POLD1P28340 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
POLD1P28340 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
POLD1P28340 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
POLD1P28340 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
POLD1P28340 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
POLD1P28340 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
POLD1P28340 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
POLD1P28340 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
POLD1P28340 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
POLD1P28340 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
POLD1P28340 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
POLD1P28340 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
POLD1P28340 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
POLD1P28340 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
POLD1P28340 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
POLD1P28340 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
POLD1P28340 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
POLD1P28340 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
POLD1P28340 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
POLD1P28340 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
POLD1P28340 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
POLD1P28340 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
POLD1P28340 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
POLD1P28340 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
POLD1P28340 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
POLD1P28340 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
POLD1P28340 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
POLD1P28340 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
POLD1P28340 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
POLD1P28340 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
POLD1P28340 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
POLD1P28340 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
POLD1P28340 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
POLD1P28340 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
POLD1P28340 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
POLD1P28340 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
POLD1P28340 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
POLD1P28340 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
POLD1P28340 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
POLD1P28340 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms