Protein–RNA interactions for Protein: P25391

LAMA1, Laminin subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 3,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA1P25391 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms