Protein–RNA interactions for Protein: P23219

PTGS1, Prostaglandin G/H synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGS1P23219 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTGS1P23219 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms