Protein–RNA interactions for Protein: P23193

TCEA1, Transcription elongation factor A protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA1P23193 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TCEA1P23193 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TCEA1P23193 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TCEA1P23193 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TCEA1P23193 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TCEA1P23193 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TCEA1P23193 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TCEA1P23193 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TCEA1P23193 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TCEA1P23193 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TCEA1P23193 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TCEA1P23193 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TCEA1P23193 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TCEA1P23193 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TCEA1P23193 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TCEA1P23193 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TCEA1P23193 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TCEA1P23193 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TCEA1P23193 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TCEA1P23193 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TCEA1P23193 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TCEA1P23193 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TCEA1P23193 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TCEA1P23193 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TCEA1P23193 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TCEA1P23193 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TCEA1P23193 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TCEA1P23193 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TCEA1P23193 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TCEA1P23193 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TCEA1P23193 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TCEA1P23193 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TCEA1P23193 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TCEA1P23193 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TCEA1P23193 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TCEA1P23193 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TCEA1P23193 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TCEA1P23193 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TCEA1P23193 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TCEA1P23193 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TCEA1P23193 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TCEA1P23193 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TCEA1P23193 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TCEA1P23193 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TCEA1P23193 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TCEA1P23193 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TCEA1P23193 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TCEA1P23193 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TCEA1P23193 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TCEA1P23193 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
TCEA1P23193 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
TCEA1P23193 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
TCEA1P23193 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TCEA1P23193 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TCEA1P23193 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TCEA1P23193 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TCEA1P23193 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TCEA1P23193 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TCEA1P23193 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TCEA1P23193 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TCEA1P23193 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TCEA1P23193 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TCEA1P23193 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TCEA1P23193 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TCEA1P23193 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TCEA1P23193 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TCEA1P23193 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TCEA1P23193 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TCEA1P23193 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TCEA1P23193 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TCEA1P23193 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TCEA1P23193 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TCEA1P23193 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TCEA1P23193 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TCEA1P23193 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TCEA1P23193 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TCEA1P23193 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TCEA1P23193 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TCEA1P23193 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TCEA1P23193 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TCEA1P23193 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TCEA1P23193 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TCEA1P23193 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TCEA1P23193 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TCEA1P23193 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TCEA1P23193 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TCEA1P23193 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TCEA1P23193 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TCEA1P23193 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TCEA1P23193 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TCEA1P23193 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TCEA1P23193 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TCEA1P23193 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TCEA1P23193 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
TCEA1P23193 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TCEA1P23193 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TCEA1P23193 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TCEA1P23193 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TCEA1P23193 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TCEA1P23193 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms