Protein–RNA interactions for Protein: P21695

GPD1, Glycerol-3-phosphate dehydrogenase [NAD(+)], cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPD1P21695 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GPD1P21695 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GPD1P21695 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GPD1P21695 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GPD1P21695 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GPD1P21695 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GPD1P21695 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GPD1P21695 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GPD1P21695 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GPD1P21695 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GPD1P21695 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GPD1P21695 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GPD1P21695 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GPD1P21695 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GPD1P21695 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GPD1P21695 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GPD1P21695 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GPD1P21695 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GPD1P21695 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GPD1P21695 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GPD1P21695 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GPD1P21695 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GPD1P21695 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GPD1P21695 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GPD1P21695 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GPD1P21695 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GPD1P21695 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GPD1P21695 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GPD1P21695 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GPD1P21695 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GPD1P21695 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GPD1P21695 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GPD1P21695 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GPD1P21695 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GPD1P21695 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GPD1P21695 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GPD1P21695 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GPD1P21695 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GPD1P21695 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GPD1P21695 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GPD1P21695 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GPD1P21695 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GPD1P21695 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GPD1P21695 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GPD1P21695 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GPD1P21695 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GPD1P21695 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GPD1P21695 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GPD1P21695 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GPD1P21695 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
GPD1P21695 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPD1P21695 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPD1P21695 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPD1P21695 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPD1P21695 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GPD1P21695 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPD1P21695 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPD1P21695 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPD1P21695 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPD1P21695 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPD1P21695 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPD1P21695 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPD1P21695 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPD1P21695 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPD1P21695 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GPD1P21695 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPD1P21695 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPD1P21695 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPD1P21695 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPD1P21695 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPD1P21695 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPD1P21695 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPD1P21695 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPD1P21695 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPD1P21695 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPD1P21695 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPD1P21695 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPD1P21695 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GPD1P21695 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPD1P21695 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPD1P21695 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPD1P21695 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPD1P21695 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPD1P21695 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPD1P21695 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPD1P21695 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPD1P21695 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPD1P21695 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPD1P21695 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GPD1P21695 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GPD1P21695 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GPD1P21695 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GPD1P21695 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GPD1P21695 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GPD1P21695 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GPD1P21695 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GPD1P21695 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GPD1P21695 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GPD1P21695 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GPD1P21695 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms