Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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CXCL3P19876 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
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CXCL3P19876 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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CXCL3P19876 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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CXCL3P19876 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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CXCL3P19876 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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CXCL3P19876 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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CXCL3P19876 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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CXCL3P19876 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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CXCL3P19876 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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CXCL3P19876 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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CXCL3P19876 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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CXCL3P19876 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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