Protein–RNA interactions for Protein: P19875

CXCL2, C-X-C motif chemokine 2, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL2P19875 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CXCL2P19875 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms