Protein–RNA interactions for Protein: P17213

BPI, Bactericidal permeability-increasing protein, humanhuman

Predictions only

Length 487 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIP17213 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BPIP17213 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BPIP17213 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BPIP17213 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BPIP17213 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BPIP17213 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BPIP17213 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BPIP17213 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BPIP17213 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BPIP17213 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BPIP17213 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BPIP17213 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BPIP17213 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BPIP17213 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BPIP17213 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BPIP17213 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BPIP17213 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BPIP17213 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BPIP17213 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BPIP17213 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BPIP17213 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BPIP17213 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BPIP17213 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BPIP17213 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BPIP17213 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BPIP17213 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BPIP17213 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BPIP17213 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BPIP17213 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BPIP17213 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
BPIP17213 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BPIP17213 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BPIP17213 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BPIP17213 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
BPIP17213 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BPIP17213 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BPIP17213 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BPIP17213 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BPIP17213 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BPIP17213 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BPIP17213 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BPIP17213 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BPIP17213 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BPIP17213 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BPIP17213 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BPIP17213 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BPIP17213 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BPIP17213 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BPIP17213 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BPIP17213 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BPIP17213 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BPIP17213 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BPIP17213 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BPIP17213 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BPIP17213 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BPIP17213 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BPIP17213 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BPIP17213 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BPIP17213 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BPIP17213 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BPIP17213 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BPIP17213 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BPIP17213 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BPIP17213 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BPIP17213 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BPIP17213 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BPIP17213 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BPIP17213 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
BPIP17213 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BPIP17213 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BPIP17213 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BPIP17213 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
BPIP17213 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BPIP17213 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BPIP17213 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BPIP17213 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
BPIP17213 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BPIP17213 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BPIP17213 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BPIP17213 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BPIP17213 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BPIP17213 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BPIP17213 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BPIP17213 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BPIP17213 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BPIP17213 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BPIP17213 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BPIP17213 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BPIP17213 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BPIP17213 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BPIP17213 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BPIP17213 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BPIP17213 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BPIP17213 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BPIP17213 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BPIP17213 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BPIP17213 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BPIP17213 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BPIP17213 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BPIP17213 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms