Protein–RNA interactions for Protein: P17174

GOT1, Aspartate aminotransferase, cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOT1P17174 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GOT1P17174 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GOT1P17174 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GOT1P17174 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GOT1P17174 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GOT1P17174 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GOT1P17174 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GOT1P17174 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GOT1P17174 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GOT1P17174 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GOT1P17174 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GOT1P17174 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GOT1P17174 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GOT1P17174 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GOT1P17174 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GOT1P17174 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GOT1P17174 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GOT1P17174 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GOT1P17174 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GOT1P17174 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GOT1P17174 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GOT1P17174 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GOT1P17174 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GOT1P17174 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GOT1P17174 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GOT1P17174 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GOT1P17174 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GOT1P17174 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GOT1P17174 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GOT1P17174 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GOT1P17174 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GOT1P17174 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GOT1P17174 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GOT1P17174 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GOT1P17174 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GOT1P17174 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GOT1P17174 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GOT1P17174 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GOT1P17174 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GOT1P17174 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GOT1P17174 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GOT1P17174 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GOT1P17174 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GOT1P17174 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GOT1P17174 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GOT1P17174 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GOT1P17174 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GOT1P17174 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GOT1P17174 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GOT1P17174 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GOT1P17174 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GOT1P17174 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GOT1P17174 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GOT1P17174 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GOT1P17174 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GOT1P17174 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GOT1P17174 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GOT1P17174 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GOT1P17174 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GOT1P17174 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GOT1P17174 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GOT1P17174 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GOT1P17174 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GOT1P17174 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GOT1P17174 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GOT1P17174 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GOT1P17174 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GOT1P17174 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GOT1P17174 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GOT1P17174 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GOT1P17174 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GOT1P17174 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GOT1P17174 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GOT1P17174 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GOT1P17174 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GOT1P17174 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GOT1P17174 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GOT1P17174 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GOT1P17174 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GOT1P17174 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GOT1P17174 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GOT1P17174 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GOT1P17174 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GOT1P17174 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GOT1P17174 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GOT1P17174 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GOT1P17174 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GOT1P17174 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GOT1P17174 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GOT1P17174 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GOT1P17174 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GOT1P17174 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GOT1P17174 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GOT1P17174 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GOT1P17174 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GOT1P17174 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GOT1P17174 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GOT1P17174 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GOT1P17174 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GOT1P17174 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms