Protein–RNA interactions for Protein: P12270

TPR, Nucleoprotein TPR, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRP12270 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TPRP12270 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
TPRP12270 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TPRP12270 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TPRP12270 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TPRP12270 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TPRP12270 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TPRP12270 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TPRP12270 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TPRP12270 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TPRP12270 TMBIM4-208ENST00000542724 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TPRP12270 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
TPRP12270 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TPRP12270 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TPRP12270 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TPRP12270 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TPRP12270 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TPRP12270 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TPRP12270 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TPRP12270 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TPRP12270 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TPRP12270 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TPRP12270 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
TPRP12270 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TPRP12270 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TPRP12270 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TPRP12270 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TPRP12270 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TPRP12270 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TPRP12270 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TPRP12270 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TPRP12270 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TPRP12270 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
TPRP12270 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TPRP12270 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TPRP12270 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TPRP12270 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TPRP12270 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TPRP12270 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TPRP12270 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TPRP12270 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TPRP12270 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TPRP12270 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TPRP12270 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
TPRP12270 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TPRP12270 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TPRP12270 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TPRP12270 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TPRP12270 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TPRP12270 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TPRP12270 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TPRP12270 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TPRP12270 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TPRP12270 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TPRP12270 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TPRP12270 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TPRP12270 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TPRP12270 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TPRP12270 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TPRP12270 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TPRP12270 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TPRP12270 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TPRP12270 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TPRP12270 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TPRP12270 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TPRP12270 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TPRP12270 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TPRP12270 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TPRP12270 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
TPRP12270 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TPRP12270 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TPRP12270 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TPRP12270 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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TPRP12270 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TPRP12270 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
TPRP12270 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TPRP12270 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
TPRP12270 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
TPRP12270 MME-218ENST00000625667 363 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TPRP12270 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TPRP12270 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TPRP12270 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TPRP12270 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TPRP12270 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TPRP12270 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TPRP12270 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TPRP12270 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
TPRP12270 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TPRP12270 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TPRP12270 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TPRP12270 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TPRP12270 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TPRP12270 PROK2-201ENST00000295619 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TPRP12270 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
TPRP12270 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
TPRP12270 FKBP1B-205ENST00000452109 953 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TPRP12270 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TPRP12270 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TPRP12270 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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