Protein–RNA interactions for Protein: P01920

HLA-DQB1, HLA class II histocompatibility antigen, DQ beta 1 chain, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQB1P01920 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC13.83□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HLA-DQB1P01920 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HLA-DQB1P01920 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HLA-DQB1P01920 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HLA-DQB1P01920 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HLA-DQB1P01920 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HLA-DQB1P01920 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HLA-DQB1P01920 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
HLA-DQB1P01920 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HLA-DQB1P01920 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
HLA-DQB1P01920 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
HLA-DQB1P01920 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HLA-DQB1P01920 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HLA-DQB1P01920 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
HLA-DQB1P01920 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
HLA-DQB1P01920 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HLA-DQB1P01920 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HLA-DQB1P01920 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HLA-DQB1P01920 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HLA-DQB1P01920 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HLA-DQB1P01920 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HLA-DQB1P01920 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HLA-DQB1P01920 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HLA-DQB1P01920 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HLA-DQB1P01920 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HLA-DQB1P01920 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HLA-DQB1P01920 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HLA-DQB1P01920 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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