Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms