Protein–RNA interactions for Protein: O95460

MATN4, Matrilin-4, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MATN4O95460 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MATN4O95460 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MATN4O95460 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MATN4O95460 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MATN4O95460 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MATN4O95460 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MATN4O95460 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MATN4O95460 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MATN4O95460 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MATN4O95460 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MATN4O95460 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MATN4O95460 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MATN4O95460 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MATN4O95460 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
MATN4O95460 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MATN4O95460 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MATN4O95460 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MATN4O95460 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MATN4O95460 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MATN4O95460 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
MATN4O95460 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MATN4O95460 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MATN4O95460 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MATN4O95460 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MATN4O95460 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MATN4O95460 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MATN4O95460 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
MATN4O95460 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MATN4O95460 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
MATN4O95460 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MATN4O95460 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MATN4O95460 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
MATN4O95460 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MATN4O95460 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MATN4O95460 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MATN4O95460 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MATN4O95460 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MATN4O95460 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MATN4O95460 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MATN4O95460 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MATN4O95460 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MATN4O95460 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MATN4O95460 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MATN4O95460 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MATN4O95460 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MATN4O95460 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MATN4O95460 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MATN4O95460 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MATN4O95460 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MATN4O95460 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MATN4O95460 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
MATN4O95460 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MATN4O95460 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MATN4O95460 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MATN4O95460 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MATN4O95460 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MATN4O95460 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MATN4O95460 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MATN4O95460 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MATN4O95460 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MATN4O95460 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MATN4O95460 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MATN4O95460 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MATN4O95460 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MATN4O95460 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MATN4O95460 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MATN4O95460 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MATN4O95460 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MATN4O95460 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MATN4O95460 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MATN4O95460 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MATN4O95460 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MATN4O95460 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MATN4O95460 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MATN4O95460 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MATN4O95460 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MATN4O95460 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MATN4O95460 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MATN4O95460 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MATN4O95460 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MATN4O95460 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MATN4O95460 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MATN4O95460 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MATN4O95460 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MATN4O95460 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MATN4O95460 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MATN4O95460 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MATN4O95460 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MATN4O95460 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MATN4O95460 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MATN4O95460 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MATN4O95460 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MATN4O95460 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MATN4O95460 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MATN4O95460 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MATN4O95460 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MATN4O95460 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MATN4O95460 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MATN4O95460 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MATN4O95460 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.5 ms