Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms