Protein–RNA interactions for Protein: O60488

ACSL4, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 4, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSL4O60488 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms