Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CREB3O43889 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CREB3O43889 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CREB3O43889 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CREB3O43889 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CREB3O43889 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CREB3O43889 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CREB3O43889 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CREB3O43889 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CREB3O43889 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CREB3O43889 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CREB3O43889 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CREB3O43889 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CREB3O43889 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CREB3O43889 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CREB3O43889 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CREB3O43889 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CREB3O43889 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CREB3O43889 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CREB3O43889 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CREB3O43889 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CREB3O43889 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CREB3O43889 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CREB3O43889 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CREB3O43889 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CREB3O43889 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CREB3O43889 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CREB3O43889 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CREB3O43889 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CREB3O43889 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CREB3O43889 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CREB3O43889 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CREB3O43889 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CREB3O43889 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CREB3O43889 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CREB3O43889 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CREB3O43889 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CREB3O43889 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CREB3O43889 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CREB3O43889 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CREB3O43889 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CREB3O43889 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CREB3O43889 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CREB3O43889 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CREB3O43889 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CREB3O43889 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CREB3O43889 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CREB3O43889 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CREB3O43889 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CREB3O43889 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CREB3O43889 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CREB3O43889 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CREB3O43889 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CREB3O43889 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CREB3O43889 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CREB3O43889 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CREB3O43889 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CREB3O43889 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CREB3O43889 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CREB3O43889 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CREB3O43889 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CREB3O43889 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CREB3O43889 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CREB3O43889 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CREB3O43889 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CREB3O43889 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CREB3O43889 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CREB3O43889 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CREB3O43889 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CREB3O43889 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CREB3O43889 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CREB3O43889 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CREB3O43889 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CREB3O43889 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CREB3O43889 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CREB3O43889 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CREB3O43889 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CREB3O43889 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CREB3O43889 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CREB3O43889 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CREB3O43889 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CREB3O43889 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CREB3O43889 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CREB3O43889 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CREB3O43889 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CREB3O43889 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CREB3O43889 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CREB3O43889 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CREB3O43889 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CREB3O43889 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CREB3O43889 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CREB3O43889 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CREB3O43889 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CREB3O43889 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CREB3O43889 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CREB3O43889 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CREB3O43889 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CREB3O43889 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CREB3O43889 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CREB3O43889 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms