Protein–RNA interactions for Protein: O15360

FANCA, Fanconi anemia group A protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCAO15360 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FANCAO15360 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FANCAO15360 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FANCAO15360 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FANCAO15360 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FANCAO15360 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FANCAO15360 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FANCAO15360 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FANCAO15360 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FANCAO15360 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FANCAO15360 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FANCAO15360 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FANCAO15360 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FANCAO15360 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FANCAO15360 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FANCAO15360 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FANCAO15360 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FANCAO15360 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FANCAO15360 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FANCAO15360 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FANCAO15360 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FANCAO15360 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FANCAO15360 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FANCAO15360 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FANCAO15360 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FANCAO15360 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
FANCAO15360 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FANCAO15360 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FANCAO15360 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FANCAO15360 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FANCAO15360 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FANCAO15360 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FANCAO15360 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
FANCAO15360 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
FANCAO15360 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
FANCAO15360 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
FANCAO15360 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FANCAO15360 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FANCAO15360 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FANCAO15360 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FANCAO15360 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FANCAO15360 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
FANCAO15360 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
FANCAO15360 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
FANCAO15360 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FANCAO15360 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FANCAO15360 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FANCAO15360 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FANCAO15360 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FANCAO15360 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FANCAO15360 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FANCAO15360 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FANCAO15360 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FANCAO15360 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FANCAO15360 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FANCAO15360 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FANCAO15360 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FANCAO15360 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FANCAO15360 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
FANCAO15360 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
FANCAO15360 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FANCAO15360 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FANCAO15360 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FANCAO15360 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FANCAO15360 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
FANCAO15360 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FANCAO15360 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FANCAO15360 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FANCAO15360 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FANCAO15360 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FANCAO15360 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FANCAO15360 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FANCAO15360 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FANCAO15360 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FANCAO15360 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
FANCAO15360 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FANCAO15360 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FANCAO15360 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FANCAO15360 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FANCAO15360 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FANCAO15360 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FANCAO15360 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FANCAO15360 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FANCAO15360 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FANCAO15360 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FANCAO15360 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FANCAO15360 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FANCAO15360 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FANCAO15360 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FANCAO15360 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FANCAO15360 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FANCAO15360 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FANCAO15360 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
FANCAO15360 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FANCAO15360 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FANCAO15360 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FANCAO15360 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
FANCAO15360 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FANCAO15360 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FANCAO15360 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms