Protein–RNA interactions for Protein: O15230

LAMA5, Laminin subunit alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 3,695 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA5O15230 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LAMA5O15230 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
LAMA5O15230 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LAMA5O15230 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LAMA5O15230 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LAMA5O15230 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LAMA5O15230 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LAMA5O15230 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LAMA5O15230 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LAMA5O15230 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LAMA5O15230 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LAMA5O15230 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LAMA5O15230 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LAMA5O15230 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LAMA5O15230 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LAMA5O15230 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LAMA5O15230 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LAMA5O15230 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LAMA5O15230 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
LAMA5O15230 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LAMA5O15230 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LAMA5O15230 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LAMA5O15230 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LAMA5O15230 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LAMA5O15230 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LAMA5O15230 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LAMA5O15230 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LAMA5O15230 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LAMA5O15230 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LAMA5O15230 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LAMA5O15230 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LAMA5O15230 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LAMA5O15230 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LAMA5O15230 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LAMA5O15230 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LAMA5O15230 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LAMA5O15230 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LAMA5O15230 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LAMA5O15230 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LAMA5O15230 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LAMA5O15230 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LAMA5O15230 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LAMA5O15230 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LAMA5O15230 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LAMA5O15230 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LAMA5O15230 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LAMA5O15230 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
LAMA5O15230 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LAMA5O15230 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LAMA5O15230 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LAMA5O15230 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
LAMA5O15230 AL138731.1-201ENST00000452624 739 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LAMA5O15230 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LAMA5O15230 DGAT2L7P-201ENST00000602462 744 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
LAMA5O15230 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LAMA5O15230 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LAMA5O15230 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LAMA5O15230 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LAMA5O15230 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LAMA5O15230 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LAMA5O15230 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LAMA5O15230 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LAMA5O15230 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
LAMA5O15230 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LAMA5O15230 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LAMA5O15230 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LAMA5O15230 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LAMA5O15230 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
LAMA5O15230 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LAMA5O15230 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LAMA5O15230 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LAMA5O15230 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LAMA5O15230 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LAMA5O15230 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LAMA5O15230 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LAMA5O15230 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LAMA5O15230 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LAMA5O15230 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LAMA5O15230 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LAMA5O15230 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LAMA5O15230 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
LAMA5O15230 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
LAMA5O15230 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LAMA5O15230 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LAMA5O15230 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LAMA5O15230 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LAMA5O15230 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LAMA5O15230 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LAMA5O15230 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LAMA5O15230 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LAMA5O15230 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LAMA5O15230 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LAMA5O15230 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LAMA5O15230 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LAMA5O15230 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LAMA5O15230 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LAMA5O15230 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LAMA5O15230 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LAMA5O15230 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LAMA5O15230 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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