Protein–RNA interactions for Protein: O15079

SNPH, Syntaphilin, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNPHO15079 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNPHO15079 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNPHO15079 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNPHO15079 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNPHO15079 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNPHO15079 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNPHO15079 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNPHO15079 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNPHO15079 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNPHO15079 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNPHO15079 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNPHO15079 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SNPHO15079 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNPHO15079 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNPHO15079 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNPHO15079 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNPHO15079 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNPHO15079 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNPHO15079 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNPHO15079 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNPHO15079 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNPHO15079 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNPHO15079 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNPHO15079 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNPHO15079 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNPHO15079 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNPHO15079 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNPHO15079 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNPHO15079 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNPHO15079 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNPHO15079 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNPHO15079 PLSCR2-201ENST00000336685 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNPHO15079 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNPHO15079 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SNPHO15079 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNPHO15079 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SNPHO15079 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNPHO15079 AC098826.2-201ENST00000452011 651 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SNPHO15079 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNPHO15079 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNPHO15079 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNPHO15079 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNPHO15079 AP002807.1-203ENST00000534517 664 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNPHO15079 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNPHO15079 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNPHO15079 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNPHO15079 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNPHO15079 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNPHO15079 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SNPHO15079 OR5P3-202ENST00000641167 1193 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNPHO15079 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SNPHO15079 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNPHO15079 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNPHO15079 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNPHO15079 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNPHO15079 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNPHO15079 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNPHO15079 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNPHO15079 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNPHO15079 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNPHO15079 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNPHO15079 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNPHO15079 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNPHO15079 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNPHO15079 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNPHO15079 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNPHO15079 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNPHO15079 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNPHO15079 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNPHO15079 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNPHO15079 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNPHO15079 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNPHO15079 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNPHO15079 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
SNPHO15079 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
SNPHO15079 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
SNPHO15079 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNPHO15079 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNPHO15079 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNPHO15079 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNPHO15079 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNPHO15079 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNPHO15079 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNPHO15079 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNPHO15079 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNPHO15079 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNPHO15079 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNPHO15079 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNPHO15079 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNPHO15079 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNPHO15079 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNPHO15079 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNPHO15079 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNPHO15079 RPL5-202ENST00000370321 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNPHO15079 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNPHO15079 AL354956.1-201ENST00000424487 467 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNPHO15079 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNPHO15079 VN1R110P-201ENST00000438988 971 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SNPHO15079 RNFT1P2-201ENST00000443064 757 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SNPHO15079 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms